Mặc dù là một online mobile game nhưng Tiếu Ngạo Giang Hồ 3D Mobile vẫn bảo đảm được sự phong phú trong hệ thống môn phái và bộ chiêu thức.
Hoa Sơn
Nổi tiếng với kiếm pháp truyền thừa hơn trăm năm, đã hình thành một bộ kiếm pháp hoàn chỉnh. Sau này thông qua các cao thủ của Hoa Sơn sửa đổi, kiếm pháp càng thêm tinh túy, danh chấn võ lâm. Vì vậy Hoa Sơn Phái còn được gọi là Hoa Sơn Kiếm Phái.
Kỹ năng Hoa Sơn kiếm pháp tinh chuẩn kì tuyệt, đồng thời cũng rất linh hoạt, ứng biến nhanh chóng. Nếu đối thủ không tập trung phòng thủ, sẽ luôn thất thế dưới kiếm chiêu nhanh nhẹn linh hoạt và dễ dàng đại bại.
Thiếu Lâm
Võ thuật Thiếu Lâm bác đại tinh thâm, Tàng Kinh Các cất giữ hơn 36 lộ quyền cước, 18 loại vũ khí. Thiếu Lâm cũng là nơi có hệ thống võ thuật lớn nhất Trung Quốc. Phàm là đệ tử thiếu lâm đều hướng về Phật, thiếu lâm là thương hiệu võ thuật nổi tiếng của Trung Quốc.
Trong Tiếu Ngạo Giang Hồ 3D Mobile (TNGHM), tăng nhân dùng phương trượng của mình làm vũ khí. Chiêu số một khi đánh ra, mạnh như lôi chấn, nhanh như phong vân, khí thế áp đảo thiên địa. Mặc dù không uyển chuyển linh hoạt như Hoa Sơn, nhưng võ thuật Thiếu Lâm lại vô cùng vững chãi và gây sát thương rất lớn.
Đường Môn
Đường Môn ám khí là thiên hạ đệ nhất. Bất luận ai khi đã trúng ám khí, chỉ có từ từ chờ vết thương hoại tử và chết. Trong TNGHM thì võ công Đường Môn không có âm độc như vậy, mà là sử dụng hỏa khí, khiến cho Đường Môn càng bất đồng với các phái khác. Kết hợp giữa hỏa khí và ám khí bổn môn, sáng lập ra cách chiến đấu độc đáo riêng biệt.
Các đệ tử Đường Môn đều có tốc độ cao, uyển chuyển linh hoạt, khiến địch nhân choáng ngợp không kịp phòng bị. Tinh thông thiết lập cơ quan bẫy sập, không thiện về cận chiến. Vì vậy yêu cầu game thủ phải lẹ tay, linh hoạt thay đổi chiến thuật, đảm bảo đối thủ không thể áp sát gây sát thương cho bản thân.
Nhật Nguyệt Thần Giáo
Tổng đàn được thiết lập ở Hắc Mộc Nhai. Do giáo chúng giết người tàn nhẫn, nên giang hồ xưng tụng là Ma Giáo, Nhật Nguyệt cùng với 5 phái võ lâm luôn bất hòa. Võ công mạnh nhất là Hấp Tinh Đại Pháp và tàn quyển bí tịch Quỳ Hoa Bảo Điển. Ngoài ra còn có độc môn ám khí Hắc Huyết Thần Châm.